Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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COL4A6Q14031 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
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COL4A6Q14031 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
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COL4A6Q14031 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
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COL4A6Q14031 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
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COL4A6Q14031 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
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