Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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ITGA9Q13797 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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ITGA9Q13797 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
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ITGA9Q13797 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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ITGA9Q13797 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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