Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MTMR3Q13615 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms