Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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