Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SRSF5Q13243 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.3 ms