Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NME3Q13232 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NME3Q13232 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NME3Q13232 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NME3Q13232 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NME3Q13232 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NME3Q13232 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NME3Q13232 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NME3Q13232 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NME3Q13232 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NME3Q13232 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NME3Q13232 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NME3Q13232 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.6 ms