Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP17L12C9JPN9 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
USP17L12C9JPN9 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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