Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MAP3K4Q9Y6R4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
MAP3K4Q9Y6R4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms