Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAF8Q9UPN6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms