Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF3Q9ULT6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms