Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MKLN1Q9UL63 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms