Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms