Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms