Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms