Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ABI3Q9P2A4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABI3Q9P2A4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABI3Q9P2A4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABI3Q9P2A4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABI3Q9P2A4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABI3Q9P2A4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABI3Q9P2A4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABI3Q9P2A4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABI3Q9P2A4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABI3Q9P2A4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABI3Q9P2A4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABI3Q9P2A4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABI3Q9P2A4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABI3Q9P2A4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABI3Q9P2A4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABI3Q9P2A4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABI3Q9P2A4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABI3Q9P2A4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABI3Q9P2A4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABI3Q9P2A4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABI3Q9P2A4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms