Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms