Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDAP2Q9NXN4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms