Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms