Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms