Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRPV4Q9HBA0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRPV4Q9HBA0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms