Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCLRE1BQ9H816 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms