Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TDRD3Q9H7E2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms