Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms