Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms