Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms