Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP3Q9BWW4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms