Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms