Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRRC1Q96M27 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms