Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms