Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms