Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms