Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms