Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms