Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC2Q8N394 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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