Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms