Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms