Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTF1AQ7RTS3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms