Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGMBQ6NW40 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms