Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms