Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01545Q5VT33 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01545Q5VT33 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01545Q5VT33 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01545Q5VT33 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01545Q5VT33 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01545Q5VT33 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01545Q5VT33 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01545Q5VT33 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01545Q5VT33 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01545Q5VT33 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01545Q5VT33 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC01545Q5VT33 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC01545Q5VT33 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC01545Q5VT33 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LINC01545Q5VT33 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LINC01545Q5VT33 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LINC01545Q5VT33 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LINC01545Q5VT33 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LINC01545Q5VT33 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LINC01545Q5VT33 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LINC01545Q5VT33 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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LINC01545Q5VT33 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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LINC01545Q5VT33 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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