Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms