Protein–RNA interactions for Protein: Q16513

PKN2, Serine/threonine-protein kinase N2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN2Q16513 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKN2Q16513 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKN2Q16513 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
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