Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS72Q15906 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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