Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SIX1Q15475 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
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