Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A1Q15459 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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