Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHROOM2Q13796 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
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SHROOM2Q13796 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
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