Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRQ13535 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRQ13535 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRQ13535 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRQ13535 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRQ13535 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRQ13535 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRQ13535 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRQ13535 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRQ13535 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRQ13535 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRQ13535 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRQ13535 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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ATRQ13535 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRQ13535 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRQ13535 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRQ13535 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRQ13535 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRQ13535 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRQ13535 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRQ13535 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRQ13535 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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ATRQ13535 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRQ13535 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRQ13535 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRQ13535 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRQ13535 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRQ13535 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRQ13535 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRQ13535 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRQ13535 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRQ13535 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRQ13535 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRQ13535 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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