Protein–RNA interactions for Protein: Q13395

TARBP1, Probable methyltransferase TARBP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1Q13395 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TARBP1Q13395 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms