Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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