Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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FOXC1Q12948 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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FOXC1Q12948 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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FOXC1Q12948 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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FOXC1Q12948 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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FOXC1Q12948 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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FOXC1Q12948 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
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